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Núcleos Especiais
  Núcleo de Estatísitca e Gerenciamento Estratégico - NUGET
Coordenador:
  Núcleo de Recursos Criminais - NUCRIM
Coordenador: Dr. Francisco Osiete Cavalcante Filho
  Núcleo Gestor de Estágio - NUGE
Coordenador: Dr. Nestor Rocha Cabral
  Núcleo de Apoio Logístico a Concursos do MP
Coordenador:
  Núcleo de Apoio Técnico - NAT
Coordenador: Dr. Nelson Ricardo Gesteira Monteiro
  Núcleo de Atuação Especial de Controle, Fiscalização e Acompanhamento de Políticas do Trânsito - NAETRAN
Coordenador:
 

Núcleo de Mediação no âmbito das Promotorias de Justiça do Estado do Ceará
Coordenadora: Dra. Iertes Meyre Gondim Pinheiro

  Núcleo de Processos Administrativos e Procedimentos Disciplinares - NUPAD
Coordenador: Dr. Marcos Tibério Castelo Aires
  Núcleo do Desporto e Defesa do Torcedor - NUDTOR
Coordenador: Dr. Francisco Xavier Barbosa Filho
  Núcleo de Recursos Cíveis - NURC
Coordenadora: Dra. Sheila Cavalcante Pitombeira
  Núcleo Especial de Combate à Sonegação Fiscal - NAESF
Coordenador: Dr. Hugo Vasconcelos Xerez
  Núcleo de Gerenciamento de Projeto
Coordenador: Dr. Joâo de Deus Duarte Rocha
  Núcleo de Segurança Institucional e Inteligência - NUSIT
Coordenador: Dr. Nelson Ricardo Gesteira Monteiro
  Núcleo de Atuação Especial Gestor da Transparência e Acesso a Informação - NUTRI
Coordenador: Dr. Pedro Casimiro Campos de Oliveira
  Núcleo Permanente para o Processo Eletrônico e Vistualização de processos Extrajudiciais no âmbito do Ministério Público do Estado do Ceará
Coordenador: Dr. Pedro Casimiro Campos de Oliveira
  Núcleo de Prevenção e Monitoramento de Conflitos Fundiários
Coordenador:
  Núcleo de Gênero Pró-Mulher
Coordenador: